文章摘要:S位点是芸苔属植物自交不亲和反应的关键位点，控制自交不亲和反应的识别与启动。为明确甘蓝S位点基因SRK和SLG的S域和SP11/SCR编码序列密码子的使用特性，利用Codon W、SPSS软件、Python程序和EMBOSS在线程序分析甘蓝41个SRK、36个SLG和11个SP11/SCR等位基因的偏好性，同时通过中性绘图、ENC-GC3绘图、PR2绘图及多元统计分析探讨基因密码子偏好性形成原因，并利用不同方法对其进行聚类分析。结果表明，甘蓝SRK、SLG和SP11/SCR基因编码序列富含A/T，密码子偏好以A/T碱基结尾，偏好性较低。自然选择是影响密码子使用模式的主要因素，突变压力为次要因素，还受到二核苷酸丰度的影响。根据RSCU值发现，SRK和SLG基因高表现密码子有4个，SP11/SCR基因有11个。基于RSCU的聚类能够较准确地反应甘蓝SRK、SLG和SP11/SCR等位基因间的关系，并与基于CDS核酸序列的聚类具有一致性和可靠性。根据密码子使用偏好性和聚类关系发现，SRK的S域和SP11/SCR编码序列在密码子偏好性上可能是协同进化的。这为更好理解甘蓝中密码子的分布机制和SRK、SLG和SP11/SCR基因的进化提供新内容。

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